Do właściwości Dyrektora Urzędu Żeglugi Śródlądowej w Szczecinie należą sprawy z zakresu administracji rządowej związane z uprawnieniem żeglugi na śródlądowych drogach wodnych w zakresie unormowanym ustawą z dnia 21 grudnia 2000r. o żegludze śródlądowej.
Do właściwości Dyrektora Urzędu Żeglugi Śródlądowej w Szczecinie należy:
nadzór nad bezpieczeństwem żeglugi śródlądowej;
przeprowadzenie inspekcji statków;
weryfikacja ustalonej głębokości tranzytowej na szlaku żeglugowym;
kontrola przestrzegania przepisów dotyczących żeglugi na śródlądowych drogach wodnych , w portach, przystaniach i zimowiskach;
kontrola stanu oznakowania szlaku żeglowego, śluz, pochylni, mostów, urządzeń nad wodami i wejść do portów;
przeprowadzenie postępowania w sprawach wypadków żeglugowych;
kontrola dokumentów przewozowych i zgodności przewożonego przezstatek ładunku z tymi dokumentami;
kontrola obcych statkow w zakresie zgodności wykonywanych przewozów z postanowieniami umów międzynarodowych oraz pozwoleń na te przewozy;
współdziałanie z innymi organami w zakresie bezpieczeństwa żeglugi, ochrona środowiska, ochrony portów lub przystani, w tym wykonywania zadań obronnych i zadań o charakterze niemiliarnym, w szczegolności zapobiegania aktom terroru i likwidacji ich skutków;
rozpatrywania skargw sprawie naruszeń praw pasażerów podróżujących drogą wodną śródlądową;
przeprowadzanie pomiaru i inspekcji technicznej statku;